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高新技术企业目前都是国家级认定的，没有省级或者市级高新技术企业，所有经认定的高新技术企业都是同一个级别。也就是说不论企业规模的大小，是在北京市的企业还是在长沙市的企业，只要被认定为高新技术企业，那么所享受的税收优惠待遇都是一样的。
当然，目前也确实有一些市级的高新技术企业认定的，比如经济发达省浙江就有市级的认定，不少地区的市级高新技术企业除了有现金奖励外，也有一些优惠政策。但是这类市级的高新技术企业认定，更多的是一种荣誉性质的奖励，由当地科技局认定（国家级高新技术企业由科技部认定），奖励力度有限，远远不及国家级高新技术企业资质的含金量，而且优惠也往往都是短期的，而且并不是所有的城市都会有这类市级认定。
因此，如果企业符合高新技术企业认定条件的话，最好还是做国-家-级高新技术企业认定，能够享受比较稳定的优惠，同时也是对企业自身科技实力的一种认证。
引用资料：上海软件企业高企优惠政策